南航股份新疆分公司积极响应国家19省市对口援疆政策，开通了喀什至乌鲁木齐至广州、喀什至乌鲁木齐至虹桥、库尔勒至乌鲁木齐至成都、伊宁至乌鲁木齐至浦东等援疆航线，同时协调吉林、黑龙江、深圳、河南等兄弟分子公司，开通援疆省市至新疆航线，在旺季期间南航实现对19省市中的18个城市通航开通航线28条，为国家援疆政策的顺利实施架设了便捷的空中通道。
    分公司重点打造5条疆内快线品牌：乌鲁木齐至伊宁、喀什、库尔勒、阿克苏、和田，完善疆内支线网络布局，提升乌鲁木齐航线枢纽中转效能；开通新疆新建机场航线乌鲁木齐至博乐、乌鲁木齐至吐鲁番航线，进一步加强疆内航线网络建设；在伊宁、库尔勒、克拉玛依等航线安排过夜航班，从而达到在早晚间与公司国内东线形成较好中转衔接效果。
    分公司新开、恢复、加密国际航线，乌鲁木齐至莫斯科航线复航；增加乌鲁木齐至新西伯利亚航线、乌鲁木齐至德黑兰航线、乌鲁木齐至杜尚别航线、乌鲁木齐至伊斯兰堡航线航班密度；开通广州至乌鲁木齐至莫斯科航线；将乌鲁木齐至胡占德航线成功转为正班经营，对中亚航线网络的拓展具有重大意义。
    分公司至中西亚国际航班实现“夕发朝至”，在提高飞机利用率的同时，形成国际转国内早航班波；借助南航各分子公司运力资源执行进疆航线，形成疆内、东线双向互转的午航班波；利用疆内过夜航班、国际航线夜航，形成东线转疆内、国内转国际的晚航班波，中转效能大幅提升，门户枢纽建设成效初显。
    分公司科学调配运力实现时刻资源突破，2010至2011冬春季南航股份新疆分公司在重点航线经营权及时刻上取得重大突破，获得虹桥、浦东、成都等机场时刻资源，乌鲁木齐至上海、乌鲁木齐至成都航线班次分别达到历史最多每日3班。
    网络结构不断优化，中转销售显著提升，门户枢纽建设成效初显，南航股份分公司在跨越式发展进程中稳步推进。