“5.12”大地震後，綿陽南郊機場作為向災區運送抗震救災人員、物資和向外轉運災區傷員、群眾的重要運輸通道，不僅承擔了巨大的飛行保障壓力，同時也面臨著巨大的疫病防控壓力。在綿陽市空中救援指揮部的領導下，機場衛生處（醫療救護中心、衛生防疫檢疫站）嚴格按照民航局《關於開展災後衛生防疫工作的通知》的電報要求，把災區傷員轉移、災後衛生防疫、疾病防控作為抗震救災工作的重中之重，以“大災之後無大疫”為工作目標，精心組織，嚴密部署，狠抓落實，及時打響災後疫情防控保衛戰。
    一、狠抓環境消毒處理，確保環境衛生清潔。針對目前進出港人員多、駐場參加抗震救災的官兵和志願者多、臨時搭建帳篷居住的人員多、日常生活垃圾多等特點，堅持每天對候機樓等公共場所、機場外環境（候機樓周圍、帳篷區、工作區及草坪）、陸航團及武警消防官兵的幾個營地實施一至兩次全面徹底的消毒。
    二、狠抓“人機”消毒，嚴防病毒、病菌帶入機場。對承擔救災物資投放、轉運災區傷員、群眾及深入一線抗震救災工作人員的直升機每架次實施一次全面消毒，對執行任務的機組人員以及轉運出來的傷員、群眾、工作人員及時進行消毒處理，做到不漏一機、一車、一人。
    三、狠抓“蚊、蠅、鼠”等病媒生物消殺工作，有效阻斷災後疾病傳播途徑。為提高消殺效果，衛生防疫人員根據病媒生物的習性規律，每天在夜晚時開展消殺工作，有力地保障了機場轄區的衛生安全。
    從5月12日至6月3日，出動醫救人員221人次，安全搶救轉運傷員52人，為災區傷員、群眾、抗震救災人員及機場周邊群眾提供醫療服務968人次，免費提供預防細菌性痢疾、傷寒、甲肝、霍亂、感染性腹瀉等傳染病和防中暑藥品近30000元；出動防疫人員256人次，環境消毒面積763萬平方米，殺蟲面積230萬平方米；為直升機消毒232架，車輛消毒29台；為災區群眾、機組人員、抗震救災官兵及災區工作人員消毒1422人，轉運災區群眾1250人。
    為支援綿陽南郊機場抗震救災衛生防疫工作，上海機場集團有限公司多方努力，採購了價值95萬餘元的救護設備和藥品等物資捐贈綿陽機場。