8月17日15時，廈門航空公司召開緊急會議，全面部署防抗“聖帕”颱風工作，並在當天20時作出取消福州機場次日全天始發航班，次日10時之後取消所有廈門和泉州機場始發航班的果斷決策。相關通知旅客和機票退票和簽轉工作也即時展開。同時，廈航還為颱風過境後在第一時間恢復航班運營提前作出計劃和準備。

    “聖帕”強度大、路徑穩定，對福建造成重大危害幾成定論。廈門航空現有6個基地，其中廈門、福州、泉州三個基地的航班運營將受到“聖帕”的嚴重影響。在召開防颱風緊急會議前，廈航各相關部門都已啟動了防抗颱風的預案。廈航運作控制中心對“聖帕”進行了充分、透徹的研究，根據其可能的路徑和進展速度，制訂出四套完備的方案提交到會上供定奪，並下發給公司各部門了解和準備。飛行、機務、客運、旅客服務部和總務部也都在會前根據各自的職能，對防抗“聖帕”進行了防範和部署。

    以保護好航空器的安全，保護好旅客的生命和財産安全為原則，廈門航空對“聖帕”堅定不移地採取“以避為主”的策略，並採取“分段決策”的方針。在當天20時的第一個決策時間點，廈門航空決定取消福州機場次日全天始發航班，次日10時之前，廈門和泉州機場正常執行所有出港航班，10時之後取消兩機場所有始發航班。廈航原本17日在福州機場過夜的11架飛機當夜即轉場到其他基地過夜，廈門基地18日10時之前，18架飛機執行各自的航班任務飛離廈門之後，在颱風警報解除之前不再回本基地，泉州機場則有4架飛機在18日10時之前飛離本場，在外站過夜。上述33架到外站過夜的飛機都載著足夠的機組、機務人員，以便在颱風過境的第一時間，廈航恢復航班運營時，這些機組人員能及時執行航班任務。