2008年3月11日，第十一届全国人民代表大会第一次会议批准国务院机构改革方案，为有利于构建综合交通运输体系，组建交通运输部，推行大部制管理，根据《国务院关于部委管理的国家局设置的通知》，设立中国民用航空局（副部级），为交通运输部管理的国家局。

　　2009年3月，国务院办公厅《关于印发中国民用航空局主要职责、内设机构和人员编制的通知》，将原中国民用航空总局规范管理航空运输业、实施航空安全和空中交通管理、组织协调重大紧急航空运输任务等职责划入中国民用航空局。民航局设12个职能机构，机关行政编制301名。

　　2009年，各省、区、市航空安全监管办公室更名为民用航空安全监督管理局，自3月24日民航天津安全监督管理局揭牌成立起，年内更名完毕。

　　2008年3月，国务院印发《关于部委管理的国家局设置的通知》，民航局划归交通运输部管理