辦公室（外事辦公室、港澳臺事務辦公室、應急管理辦公室）

航空安全辦公室

政策法規處

計劃統計處（節能減排辦公室）

財務處

人事科教處

運輸管理處（國防動員辦公室）

通用航空處

飛行標準處

外國航空公司運作監管處

航空衛生處

航務管理處

適航維修處

機場管理處

空中交通管制處

通信導航監視處

航空氣象處

公安局

黨委辦公室（機關黨委、團委辦公室）

工會辦公室

紀檢監察處

離退休幹部處

黑龍江安全監督管理局

吉林安全監督管理局

遼寧安全監督管理局

大連安全監督管理局

中國民用航空局

黑龍江省人民政府

吉林省人民政府

遼寧省人民政府

大連市人民政府