2008年9月23日，南航北京分公司各单位首次召开合作协调会，共同商讨进驻首都机场T2航站楼南塔4楼后的合作问题。此前，南航北京分公司已于2008年6月正式转入T2航站楼。

    为把首都机场建成为南航第二个航空枢纽，南航北京分公司投入大笔改造资金，对首都机场T2航站楼南塔4楼进行了重点装修，购置一批性能优良的通讯设备，并订购了一批运行工作所需要的办公家具，经过近3个月改造、安装和调试，运行指挥部的办公环境有了很大改善。按照工作计划，机务、货运、生调、油料各相关保障单位将陆续派专人进驻，运行指挥部与其他各保障单位将面对面的直接联系。

    合作协调会上，南航北京分公司各单位就人员进驻、席位安排、日常行政管理等方面的问题进行了商讨，重点对各单位今后需要协调的工作提出了建设性的意见，运行指挥部将根据协调会上提出的问题一一整理给予解决。各单位在同一场所共同办公，将加快单位间的信息传递，从而更有利于运行指挥部及时发现和处理影响航班安全、正常和服务的各种问题，为首都机场出行的南航航班提供更为可靠的保障。