綜合司

航空安全辦公室

政策法規司

發展計劃司

財務司

人事科教司

國際司（港澳臺辦公室）

運輸司

飛行標準司

航空器適航審定司

機場司

空管行業管理辦公室

公安局

直屬機關黨委（思想政治工作辦公室）

全國民航工會

離退休幹部局

華北地區管理局

東北地區管理局

華東地區管理局

中南地區管理局

西南地區管理局

西北地區管理局

新疆管理局

空中交通管理局

機關服務局

中國民航大學

中國民航飛行學院

中國民航管理幹部學院

廣州民航職業技術學院

上海民航職業技術學院

中國民航科學技術研究院

民航第二研究所

中國民航報社出版社（中國民用航空宣傳教育中心）

清算中心

資訊中心

民航專業工程品質監督總站

首都機場集團

審計中心

國際合作中心

中國民航機場建設集團有限公司

中國民用航空適航審定中心

民航博物館

民航醫學中心(總醫院)

中華人民共和國常駐國際民航組織理事會代表處

中央政府門戶網站

交通運輸部

國家鐵路局

國家郵政局

民航社團組織

航空運輸企業

民用機場

民航運輸保障企業